Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC191Q8NCU4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC191Q8NCU4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC191Q8NCU4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC191Q8NCU4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms