Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBL4BQ8N7F7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL4BQ8N7F7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL4BQ8N7F7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms