Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC71Q8N4P6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC71Q8N4P6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC71Q8N4P6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC71Q8N4P6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms