Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SVBPQ8N300 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SVBPQ8N300 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SVBPQ8N300 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms