Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL6

FAM20C, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20CQ8IXL6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM20CQ8IXL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM20CQ8IXL6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM20CQ8IXL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms