Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RHOT2Q8IXI1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RHOT2Q8IXI1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOT2Q8IXI1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms