Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CD302Q8IX05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CD302Q8IX05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CD302Q8IX05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CD302Q8IX05 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms