Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM139Q8IV31 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM139Q8IV31 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM139Q8IV31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM139Q8IV31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms