Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIM73Q86UV7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIM73Q86UV7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM73Q86UV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms