Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LDB1Q86U70 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LDB1Q86U70 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LDB1Q86U70 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LDB1Q86U70 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms