Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00596Q86U02 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00596Q86U02 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00596Q86U02 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms