Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KCNIP4Q6PIL6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP4Q6PIL6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms