Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO38Q6PIJ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FBXO38Q6PIJ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FBXO38Q6PIJ6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms