Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYCE2Q6PIF2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYCE2Q6PIF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYCE2Q6PIF2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYCE2Q6PIF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms