Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW5

FAM45BP, Putative protein FAM45B, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM45BPQ6NSW5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM45BPQ6NSW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM45BPQ6NSW5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM45BPQ6NSW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms