Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPRIN2Q6IMN6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPRIN2Q6IMN6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms