Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHAF4Q5VUM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SDHAF4Q5VUM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHAF4Q5VUM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms