Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.31■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
EFCAB2Q5VUJ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
EFCAB2Q5VUJ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
EFCAB2Q5VUJ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms