Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAMEF20Q5VT98 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20Q5VT98 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms