Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LGSNQ5TDP6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LGSNQ5TDP6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LGSNQ5TDP6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms