Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC183Q5T5S1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC183Q5T5S1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC183Q5T5S1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC183Q5T5S1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms