Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PERM1Q5SV97 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PERM1Q5SV97 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PERM1Q5SV97 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PERM1Q5SV97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms