Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACER2Q5QJU3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACER2Q5QJU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACER2Q5QJU3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms