Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAPPA-AS1Q5QFB9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms