Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKY1

LRRC10, Leucine-rich repeat-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10Q5BKY1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC10Q5BKY1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC10Q5BKY1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRC10Q5BKY1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms