Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCGF3Q3KNV8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCGF3Q3KNV8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCGF3Q3KNV8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms