Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DUSP6Q16828 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DUSP6Q16828 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DUSP6Q16828 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DUSP6Q16828 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms