Protein–RNA interactions for Protein: Q16820

MEP1B, Meprin A subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEP1BQ16820 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MEP1BQ16820 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MEP1BQ16820 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEP1BQ16820 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MEP1BQ16820 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEP1BQ16820 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MEP1BQ16820 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms