Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SS18Q15532 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18Q15532 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18Q15532 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18Q15532 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18Q15532 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SS18Q15532 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18Q15532 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18Q15532 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18Q15532 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18Q15532 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18Q15532 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18Q15532 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SS18Q15532 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SS18Q15532 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SS18Q15532 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SS18Q15532 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SS18Q15532 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SS18Q15532 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SS18Q15532 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18Q15532 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18Q15532 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18Q15532 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18Q15532 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SS18Q15532 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18Q15532 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18Q15532 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18Q15532 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18Q15532 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18Q15532 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18Q15532 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18Q15532 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18Q15532 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18Q15532 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SS18Q15532 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18Q15532 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18Q15532 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18Q15532 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18Q15532 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18Q15532 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18Q15532 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SS18Q15532 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SS18Q15532 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SS18Q15532 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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