Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSME4Q14997 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSME4Q14997 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSME4Q14997 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PSME4Q14997 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
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