Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VGLL4Q14135 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VGLL4Q14135 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
VGLL4Q14135 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
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