Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PMS2P11Q13670 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PMS2P11Q13670 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PMS2P11Q13670 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms