Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CUL3Q13618 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CUL3Q13618 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CUL3Q13618 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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