Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB40BQ12829 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB40BQ12829 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB40BQ12829 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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