Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABPB1Q06547 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GABPB1Q06547 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms