Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSTF1Q05048 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSTF1Q05048 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSTF1Q05048 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSTF1Q05048 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms