Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RELQ04864 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RELQ04864 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RELQ04864 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RELQ04864 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RELQ04864 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RELQ04864 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RELQ04864 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RELQ04864 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RELQ04864 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RELQ04864 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RELQ04864 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RELQ04864 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RELQ04864 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RELQ04864 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms