Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NUCB1Q02818 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NUCB1Q02818 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NUCB1Q02818 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms