Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBXN2AP68543 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBXN2AP68543 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UBXN2AP68543 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms