Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM4P67936 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM4P67936 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM4P67936 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM4P67936 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM4P67936 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM4P67936 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM4P67936 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM4P67936 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM4P67936 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM4P67936 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM4P67936 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPM4P67936 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM4P67936 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM4P67936 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM4P67936 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM4P67936 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPM4P67936 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPM4P67936 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPM4P67936 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPM4P67936 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPM4P67936 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPM4P67936 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPM4P67936 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPM4P67936 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPM4P67936 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPM4P67936 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM4P67936 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM4P67936 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM4P67936 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM4P67936 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM4P67936 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM4P67936 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPM4P67936 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM4P67936 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM4P67936 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM4P67936 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPM4P67936 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM4P67936 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM4P67936 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM4P67936 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM4P67936 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM4P67936 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM4P67936 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM4P67936 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPM4P67936 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPM4P67936 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM4P67936 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM4P67936 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM4P67936 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM4P67936 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM4P67936 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPM4P67936 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM4P67936 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM4P67936 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM4P67936 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM4P67936 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM4P67936 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM4P67936 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPM4P67936 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TPM4P67936 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM4P67936 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM4P67936 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TPM4P67936 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM4P67936 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM4P67936 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM4P67936 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM4P67936 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM4P67936 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TPM4P67936 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM4P67936 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM4P67936 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM4P67936 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM4P67936 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM4P67936 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TPM4P67936 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM4P67936 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM4P67936 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM4P67936 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM4P67936 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM4P67936 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM4P67936 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM4P67936 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TPM4P67936 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM4P67936 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM4P67936 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM4P67936 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TPM4P67936 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPM4P67936 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPM4P67936 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPM4P67936 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TPM4P67936 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms