Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RPL23AP62750 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPL23AP62750 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPL23AP62750 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms