Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBX2P52951 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBX2P52951 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GBX2P52951 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBX2P52951 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX2P52951 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX2P52951 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX2P52951 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX2P52951 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX2P52951 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX2P52951 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX2P52951 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBX2P52951 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX2P52951 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX2P52951 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GBX2P52951 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX2P52951 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX2P52951 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX2P52951 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX2P52951 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX2P52951 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX2P52951 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX2P52951 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBX2P52951 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX2P52951 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX2P52951 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX2P52951 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX2P52951 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX2P52951 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBX2P52951 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX2P52951 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX2P52951 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX2P52951 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBX2P52951 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX2P52951 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX2P52951 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX2P52951 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX2P52951 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX2P52951 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX2P52951 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBX2P52951 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GBX2P52951 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX2P52951 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX2P52951 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBX2P52951 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX2P52951 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBX2P52951 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBX2P52951 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBX2P52951 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBX2P52951 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBX2P52951 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GBX2P52951 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBX2P52951 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX2P52951 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBX2P52951 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX2P52951 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBX2P52951 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX2P52951 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GBX2P52951 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GBX2P52951 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX2P52951 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX2P52951 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GBX2P52951 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX2P52951 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX2P52951 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX2P52951 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GBX2P52951 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX2P52951 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX2P52951 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBX2P52951 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GBX2P52951 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX2P52951 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GBX2P52951 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GBX2P52951 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX2P52951 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX2P52951 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GBX2P52951 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GBX2P52951 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX2P52951 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX2P52951 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX2P52951 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX2P52951 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX2P52951 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GBX2P52951 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GBX2P52951 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX2P52951 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX2P52951 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX2P52951 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GBX2P52951 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms