Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AFF1P51825 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF1P51825 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF1P51825 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF1P51825 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF1P51825 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AFF1P51825 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF1P51825 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF1P51825 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF1P51825 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF1P51825 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF1P51825 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AFF1P51825 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFF1P51825 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFF1P51825 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AFF1P51825 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
AFF1P51825 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
AFF1P51825 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF1P51825 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF1P51825 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF1P51825 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF1P51825 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF1P51825 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF1P51825 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AFF1P51825 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF1P51825 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF1P51825 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF1P51825 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF1P51825 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF1P51825 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF1P51825 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF1P51825 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AFF1P51825 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF1P51825 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF1P51825 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF1P51825 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF1P51825 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF1P51825 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AFF1P51825 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFF1P51825 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AFF1P51825 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF1P51825 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF1P51825 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF1P51825 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF1P51825 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF1P51825 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AFF1P51825 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AFF1P51825 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF1P51825 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF1P51825 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF1P51825 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AFF1P51825 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF1P51825 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF1P51825 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF1P51825 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AFF1P51825 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF1P51825 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF1P51825 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF1P51825 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF1P51825 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF1P51825 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AFF1P51825 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF1P51825 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF1P51825 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF1P51825 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF1P51825 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF1P51825 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AFF1P51825 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFF1P51825 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFF1P51825 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFF1P51825 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AFF1P51825 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AFF1P51825 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF1P51825 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF1P51825 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF1P51825 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF1P51825 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF1P51825 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF1P51825 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AFF1P51825 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF1P51825 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF1P51825 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF1P51825 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF1P51825 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AFF1P51825 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFF1P51825 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AFF1P51825 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF1P51825 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF1P51825 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF1P51825 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF1P51825 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AFF1P51825 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms