Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN5P51795 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLCN5P51795 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLCN5P51795 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLCN5P51795 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms