Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSC2P49815 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC2P49815 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC2P49815 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC2P49815 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC2P49815 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC2P49815 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC2P49815 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSC2P49815 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSC2P49815 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC2P49815 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC2P49815 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TSC2P49815 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSC2P49815 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSC2P49815 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC2P49815 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC2P49815 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC2P49815 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC2P49815 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC2P49815 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC2P49815 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSC2P49815 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSC2P49815 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC2P49815 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC2P49815 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC2P49815 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC2P49815 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC2P49815 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC2P49815 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSC2P49815 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC2P49815 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC2P49815 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC2P49815 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSC2P49815 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC2P49815 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC2P49815 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSC2P49815 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC2P49815 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC2P49815 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC2P49815 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSC2P49815 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC2P49815 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC2P49815 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC2P49815 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSC2P49815 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC2P49815 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC2P49815 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC2P49815 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC2P49815 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC2P49815 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC2P49815 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSC2P49815 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC2P49815 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC2P49815 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC2P49815 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC2P49815 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC2P49815 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC2P49815 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSC2P49815 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC2P49815 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC2P49815 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC2P49815 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC2P49815 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC2P49815 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC2P49815 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TSC2P49815 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC2P49815 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC2P49815 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC2P49815 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC2P49815 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TSC2P49815 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSC2P49815 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TSC2P49815 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TSC2P49815 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TSC2P49815 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms