Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARCN1P48444 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARCN1P48444 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARCN1P48444 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARCN1P48444 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms