Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
NCAPD3P42695 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC43.98■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC43.95■■■■■ 4.63
NCAPD3P42695 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC43.89■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC43.89■■■■■ 4.62
NCAPD3P42695 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC43.84■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC43.83■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
NCAPD3P42695 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC43.82■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC43.8■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC43.8■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.79■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC43.76■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
NCAPD3P42695 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC43.74■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
NCAPD3P42695 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms