Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGHMBP2P38935 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IGHMBP2P38935 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IGHMBP2P38935 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IGHMBP2P38935 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms