Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SERPINF1P36955 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SERPINF1P36955 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SERPINF1P36955 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms