Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GBP2P32456 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP2P32456 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP2P32456 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP2P32456 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP2P32456 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP2P32456 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP2P32456 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP2P32456 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GBP2P32456 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP2P32456 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP2P32456 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP2P32456 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP2P32456 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP2P32456 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP2P32456 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GBP2P32456 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP2P32456 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP2P32456 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP2P32456 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP2P32456 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP2P32456 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP2P32456 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP2P32456 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GBP2P32456 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP2P32456 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP2P32456 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP2P32456 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP2P32456 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP2P32456 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP2P32456 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GBP2P32456 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP2P32456 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP2P32456 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP2P32456 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GBP2P32456 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GBP2P32456 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GBP2P32456 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP2P32456 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP2P32456 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP2P32456 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP2P32456 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP2P32456 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP2P32456 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GBP2P32456 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP2P32456 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP2P32456 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP2P32456 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP2P32456 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP2P32456 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GBP2P32456 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP2P32456 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP2P32456 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP2P32456 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP2P32456 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP2P32456 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GBP2P32456 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GBP2P32456 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP2P32456 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP2P32456 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP2P32456 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP2P32456 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP2P32456 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GBP2P32456 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP2P32456 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP2P32456 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP2P32456 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GBP2P32456 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP2P32456 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP2P32456 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP2P32456 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GBP2P32456 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP2P32456 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP2P32456 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP2P32456 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP2P32456 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP2P32456 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP2P32456 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP2P32456 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP2P32456 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP2P32456 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP2P32456 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP2P32456 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms